1x 10 Identità nascoste

Beckett e Castle si ritrovano a indagare su un chirurgo plastico torturato e ucciso nella sua auto con un sacchetto di plastica. La pista li porta ad un testimone, protetto dalla procura, che ha subito un'operazione chirurgica per entrare nel programma di protezione testimoni. Nel frattempo Castle, con l'aiuto di un amico medico legale, fa analizzare il caso della morte della madre dell'agente Beckett anche se lei gli ha proibito tassativamente di indagare, pena la rottura del loro rapporto in modo definitivo. Nell'indagare sul testimone protetto Beckett coinvolge l'FBI chiedendo un favore a una persona. Questi la aiuta facendole avere un incontro riservato con il testimone ma, dopo l'incontro, il testimone e l'agente vengono assaliti e quasi uccisi. Indagando su chi potesse averli seguiti Beckett e Castle trovano l'assassina che si è finta l'assistente del dottore per poter avvicinare il testimone e ucciderlo per conto della propria famiglia mafiosa contro cui il testimone stava per deporre. Al termine dell'episodio Castle scopre che la madre di Beckett è stata uccisa e che anche altre persone sono morte nello stesso modo e nello stesso periodo facendole passare per omicidi casuali. Molto combattuto, decide di rivelare il tutto a Beckett.